数学科学学院坚持“把握主流，做强基础，做大应用，注重交叉，发展特色”的办学思路，构建起了具有交大特色的数学课程的教学体系。目前拥有国家级精品课程2门（《数学实验》、《高等数学》），上海市精品课程8门（《高等数学》、《数学实验》、《数学分析》、《大学代数》、《高等代数》、《工程数学》、《常微分方程》、《概率论与数理统计》），上海高校示范性全英语教学立项课程1门（《数学分析》）。国家级精品视频公开课、我校首批MOOC上线的两门课程之一（《数学之旅》），国家级精品资源共享课（《数学实验》），上海市教学成果奖一等奖1项，二等奖1项，校卓越教学奖1位，“十二五”国家级规划教材2本（《数理金融-资产定价与金融决策理论（第二版）》、《数学实验》）。设有教育部国家工科数学教学基地。2007年工科数学基地教学团队入选国家级教学团队。