毕业前，人事档案和党组织档案均在上海学校一起存放。毕业后，在上海就业，人事档案留在上海学生事务中心；党组织关系转移到异地并将党组织档案取出寄往异地。

这样操作是否可以？会对以后人事迁移产生影响么？

没什么大的问题。建议档案由户籍地人才中心管理。